是將推掃型高光譜相機與顯微鏡結合，構成顯微高光譜系統的主體，再借助顯微鏡的光路系統、不同倍率的物鏡（可見）、不同倍率的反射物鏡（紅外）以及二維電控掃描平臺來實現的。
可見近紅外顯微系統采用透射式的光路結構，在不同放大倍率物鏡下，可以清楚的觀察、采集到相應的顯微高光譜數據，系統采用的是二維平移機構，X 軸為圖像掃描軸，Y 軸為調焦軸，實現自動曝光、自動對焦等流程。
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